La chiesa non era soltanto luogo di culto ma si presentava, dalla sua fondazione, come istituzione di patronato laicale della Città.

La chiesa è menzionata la prima volta come chiesa di S. Giovanni nel casale di SS. Giovanni e Paolo in una pergamena del gennaio 1284.

La chiesa di San Nicola de Figulis è dedicata a San Nicola di Bari.

La chiesa è così chiamata perché l’ultimo dei Conti Longobardi di Caiazzo, Landolfo Franco, ne avrebbe curato la fondazione prima del 1065.

La chiesa situata nel villaggio di Cesarano è intitolata a Rufo, diacono della chiesa di Capua, martirizzato il 27 agosto nella persecuzione ordinata dall’imperatore Diocleziano nell’anno 303.

Secondo gli storici locali la Chiesa e il Convento di San Francesco sono sorti su un'area ove esisteva la piccola Chiesa di Santa Maria del Popolo

Il clerico Giulio d'Ettorre, nobile Caiatino e Vicario Generale della Diocesi, nel 1615 fondò un Conservatorio femminile sotto il patrocinio della SS. Concezione di Maria.